Известно, что комплементарные цепи нуклеиновых кислот антипараллельны (5’ концу в одной цепи соответствует 3’ конец другой цепи). Синтез нуклеиновых кислот начинается с 5’ конца. Рибосома движется по иРНК в направлении от 5’ к 3’ концу. Все виды РНК синтезируются на ДНК-матрице. В цепи РНК и ДНК могут иметься специальные комплементарные участки — палиндромы, благодаря которым у молекулы может возникать вторичная структура. Фрагмент молекулы ДНК, на которой синтезируется участок центральной петли тРНК, имеет следующую последовательность нуклеотидов (нижняя цепь матричная (транскрибируемая)):
5’-АТЦГГЦТАТГЦГЦЦГАТ-3’
3’-ТАГЦЦГАТАЦГЦГГЦТА-5’
Установите нуклеотидную последовательность участка тРНК, который синтезируется на данном фрагменте. Найдите на данном участке палиндром и установите вторичную структуру центральной петли тРНК. Определите аминокислоту, которую будет переносить эта тРНК в процессе биосинтеза белка, если антикодон равноудален от концов палиндрома. Ответ поясните. Для решения задания используйте таблицу генетического кода. При написании нуклеиновых кислот указывайте направление цепи.
Элементы ответа:
1) нуклеотидная последовательность участка тРНК:
5’-АУЦГГЦУАУГЦГЦЦГАУ-3’;
2) палиндром в последовательности:
5’-АУЦГГЦ-3’ (3’-УАГЦЦГ-5’);
3) вторичная структура тРНК:
4) нуклеотидная последовательность антикодона в тРНК: 5’-АУГ-3’ (3’-ГУА-5’) (выделен на тРНК);
5) антикодон соответствует кодону иРНК 5’-ЦАУ-3’ (3’-УАЦ-5’);
6) по таблице генетического кода этому кодону соответствует аминокислота гис (гистидин), которую будет переносить данная тРНК.