Известно, что комплементарные цепи нуклеиновых кислот антипараллельны (5’ концу в одной цепи соответствует 3’ конец другой цепи). Синтез нуклеиновых кислот начинается с 5’ конца. Рибосома движется по иРНК в направлении от 5’ к 3’ концу. Фрагмент молекулы ДНК имеет следующую последовательность:
5’-АТЦГГЦАТАГЦТАТГ-3’
3’-ТАГЦЦГТАТЦГАТАЦ-5’
Определите последовательность фрагмента полипептида, кодируемого данным участком ДНК, если известно, что этот полипептид начинается с аминокислоты Гис и имеет длину не менее четырёх аминокислот. Объясните последовательность Ваших действий. Для решения задания используйте таблицу генетического кода. При написании нуклеиновых кислот указывайте направление цепи.
Элементы ответа:
1) в задаче не говорится какая цепь смысловая, какая матричная — просто фрагмент ДНК. По условиям задачи длина белка не менее 4 аминокислот. Значит, кодон гис может быть или первым или вторым по счету. Сначала находим кодоны гис — это два кодона ЦАУ (в матричной ДНК соответствует ГТА) и ЦАЦ (в матричной ДНК соответствует ГТГ);
2) рассматриваем два варианта: если матричной является нижняя цепь, то ГТА там есть, но тогда не соответствует условию (не менее 4-х аминокислот). Смотрим второй вариант: матричной является верхняя цепь и если смотреть с 3’ конца, то все сходится: «читаем» все с 3’ конца и комплементарно находим иРНК и аминокислоты по таблице;
3) 5’-АТЦГГЦАТАГЦТАТГ-3’
3’-ТАГЦЦГТАТЦГАТАЦ-5’
«Зеркально» переворачиваем цепь с 3’ конца:
ДНК: 5’-ЦАТАГЦТАТГЦЦГАТ-3’
3’-ГТАТЦГАТАЦГГЦТА-5’;
4) иРНК: 5’-ЦАУАГЦУАУГЦЦГАУ-3’;
5) аминокислоты: гис-сер-тир-ала-асп.